与硬盘产品不同，硬盘的数据传输率强调的是内部传输率（硬盘磁头与缓存之间的数据传输率），而移动硬盘则更多是其接口的数据传输率。因为移动硬盘是通过外部接口与系统相连接，其接口的速度就限制着移动硬盘的数据传输率。虽然目前的USB1.1接口能提供12Mbps；USB 2.0接口能提供480Mbps；IEEE1394a接口能提供400Mbps；IEEE1394b能提供800 Mbps的数据传输率，但在实际应用中会因为某些客观的原因（例如存储设备采用的主控芯片、电路板的制作质量是否优良等），减慢了在应用中的传输速率。比如说同样是USB 1.1接口的移动硬盘产品，一个可以提供1.2MB/S的读取速度，而另一个则能提供900KB/S的读取速度，这就是因为二者所采用的主控芯片等部件上的差异所造成的。
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