除了对攻击发出警报，有些IDS还能自动抵御这些攻击。抵御方式有很多：首先，可以通过重新配置路由器和防火墙，拒绝那些来自同一地址的信息流；其次，通过在网络上发送reset包切断连接。但是这两种方式都有问题，攻击者可以反过来利用重新配置的设备，其方法是：通过伪装成一个友方的地址来发动攻击，然后IDS就会配置路由器和防火墙来拒绝这些地址，这样实际上就是对"自己人"拒绝服务了。发送reset包的方法要求有一个活动的网络接口，这样它将置于攻击之下，一个补救的办法是：使活动网络接口位于防火墙内，或者使用专门的发包程序，从而避开标准IP栈需求。
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