硬盘不同格式下速率快慢的秘密有谁知道？

我在做XP系统备份（还原）时发现（C盘备份到D盘），要是C盘是FAT32,D盘是NTFS时，无论是备份或还原都比C盘和D盘都是NTFS时要快很多,是为什么呢？（差别为1200MB/min-1500MB/min，差别很大吧)。
　 　 我的配置为：C3－1200超外频133到1600，815EPT板，512MB/PC133,木星易拓40G7200转硬盘2M缓存。FX5600显卡。
　 请高手们都说一下自己的看法，解开这秘密吧！我是用一键GHOST硬盘版来做备份的。