很多企业还在各种场合下使用各种版本的Windows 9x，因此，要在这些环境下使用SQL Server 2000，我们必须首先了解Windows 9x的性能和局限。
客户端软件 SQL Server 2000客户端软件是企业版、标准版和专业版都附带的。你可以仅使用SQL Server 2000安装盘里的客户端工具将客户端软件安装到客户机，也可以使用联通性选项（包含在SQL Server客户端访问许可证中）。这个软件的作用是管理SQL Server并可以在SQL数据库中进行ad hoc查询。
这个软件有一些局限。Windows 98和 Windows 95并不提供浏览器支持，这意味着SQL Server对话框不能显示服务器的列表。因此，当你使用注册服务器，注册服务器向导以及查询分析器登陆的对话框的时候，你需要手工输入正确的服务器名。
同样地，企业管理器和服务器代理这样的SQL Server工具必须由用户设置检测服务状态间隔。
服务器端软件所有的Win9x 操作系统均不能为强化的SQL Server 2000系统提供高效的环境，因为公司级别应用程序的特性在这里是不可用的。因此，你不能在Win9x 系统上使用企业版的SQL Server 2000，不过你仍然可以使用个人版或是桌面引擎版。
SQL Server 2000个人版和桌面引擎比较适合小规模的项目，这些项目需要单独安装作为安全保障(例如，没有足够资金，仅使用win98的研究机构)。
SQL Server 2000桌面引擎是可以重分发版本的关系型数据库引擎，它不需要额外的许可证。然而，桌面引擎还是有一些严重的局限，主要包括以下几点：
它不能自动启动 它没有事件日志 SQL Server性能监视器不可用 它并不包含任何的SQL Server命令，也没有图形用户界面 它不支持named pipes、Banyan VINES servers或是AppleTalk Net-Libraries 它不支持Windows NT集成身份认证 使用多协议加密的Win98客户端不能连接到SQL Server 它不支持异步I/O，因此它不能使用某些I/O优化