一、启动方式有差异
虽然USB闪存盘引导功能的实现很简单，在制作好可启动的闪存盘后设定主板BIOS即可。但是由于USB存储设备的出现时间还不长，现有主板都将其模拟为其他存储设备的启动方式，比如现在很多新型主板支持的USB启动设备有：USB_HDD、USB_FDD、USB_ZIP USB_CDROM等几类。这些不同的启动方式之间并没有什么本质的区别，但仍存在一些小的差异。
用USB_FDD方式启动，启动完成后会出现A:盘符，而且容量只有1.44M；而采用USB_HDD的方式启动，在启动系统之后出现的盘符是C:，原来硬盘的C盘则变成了D盘，其余盘符依次后推，可以使用闪存盘的全部容量。USB_ZIP与USB_HDD启动方式的区别在于USB_ZIP会在逻辑硬盘后虚拟一个硬盘，里面装载一些DOS的常用命令，而USB-HDD就不会加载这些命令。现在大多数USB闪存盘都只支持一种启动方式，但一些名牌产品则支持两种不同的启动方式。
二、启动之空间利用率
另外还要注意，有些有启动功能的USB闪存存储器是将启动区和使用区分别独立出来，用户不能同时使用启动区和使用区的容量，这在一定程度上也造成了浪费。而有些产品的启动区和使用区是合在一起的，用户可以完全使用全部容量，而不用担心浪费。
三、其实任何闪盘都会自启动
其实，要用USB闪存盘启动系统的关键是主板支持USB设备启动，不要迷信所谓的“真正自启动”功能，任何闪存盘在经过一定的手段制作后，都能够成为启动盘。
还有一点需要提醒的是，即使你的主板不支持闪存盘启动，也是有办法解决的，那就是升级主板BIOS，当然新版的BIOS程序要支持闪存盘启动才行。一般大的主板厂商在这方面做得比较好，如果是杂牌主板无法找到合适BIOS的升级程序，就只能放弃USB闪存盘的启动功能了。
（出处：http://www.sheup.com）